Нефть Brent
$73.30
+3.08%
1
Коронавирус SARS-CoV-2 начал распространяться по Уханю раньше, чем думали ученые. Об этом свидетельствует исследование, опубликованное в Nature Microbiology во вторник, 7 апреля.
Отмечается, что медики обнаружили следы коронавируса в образцах мокроты жителей Уханя, которые страдали от гриппоподобных инфекций осенью-зимой 2019 года.
“Мы повторно проанализировали 640 образцов мокроты из горла пациентов, страдавших от гриппоподобных инфекций в промежутке между 6 октября 2019 года и 21 января 2020 года. В девяти из них оказались следы РНК коронавируса нового типа. Это говорит о том, что локальная передача вируса началась в Ухане уже в начале января этого года”, – сказано в исследовании.
Некоторые исследователи считают, что вирус SARS-CoV-2 появился в результате рекомбинаций, обмена генетическим материалом между разными типами коронавирусов. Другие предполагают, что он возник в ходе длительной самостоятельной эволюции вируса, похожего по своей структуре на патоген RaTG13, который поражает летучих мышей.
При этом многие биологи-эволюционисты считают, что “предок” возбудителя эпидемии COVID-19 появился еще ранней осенью или летом 2019 года. Но их оппоненты уверены в том, что первая жизнеспособная версия SARS-CoV-2 возникла за несколько недель до начала эпидемии в Ухане.
Ученые исследовали образцы биологических материалов 600 жителей Уханя, которые страдали от гриппоподобных болезней и обратились в разные клиники города в конце осени и начале зимы, в пик сезонной эпидемии гриппа. Сразу девять жителей Уханя, которые обратились за помощью к врачам, на самом деле болели COVID-19, а не гриппом или другими классическими респираторными инфекциями.
Первый его носитель среди изученных пациентов, 46-летняя женщина, пошла в больницу уже 4 января этого года, за несколько недель до того, как вирус, предположительно, начал массово распространяться по городу и провинции Хубэй.
Среди ученых, исследователей и тех, кто просто интересуется происхождением нового коронавируса SARS-CoV-2, не утихают дискуссии относительно появления этого смертоносного микроорганизма. В исследовании, опубликованном в последние дни марта в журнале Nature Medicine, ученые сравнили его генетические данные с данными других коронавирусов и обосновали свою версию – он имеет все признаки возникновения в природе, а не в лаборатории.
Команда исследователей пришла к выводу, что SARS-CoV-2, вероятно, появился в результате естественного отбора. Эту теорию описал еще Чарльз Дарвин. Это когда организмы адаптируются к окружающей среде, чтобы выжить.
«Сравнивая доступные данные о последовательности генома для известных штаммов коронавируса, мы можем твердо определить, что SARS-CoV 2 возник в результате природных процессов», – отмечает соавтор исследования, доцент кафедры иммунологии и микробиологии в Scripps Research Кристиан Андерсен.
Уточним, вызывающий заболевание COVID-19 микроорганизм является седьмым известным членом семейства коронавирусов, который заражает людей.
При этом, отметим, в мире активно муссируется версия, о том, что SARS-CoV-2 появился в лаборатории. Ранее МОЗ Украины опровергло другую популярную версию происхождения нового коронавируса, (о том, что якобы инфицированная летучая мышь заразила курицу, которую потом кто-то купил на рынке в китайском Ухане, а дальше люди передавали вирус друг другу).
Ранее на основании анализа генома эксперты предположили, что два неких вируса животных могли объединиться, образовав SARS-CoV-2.
При этом остается неясным, в организме какого животного это могло произойти, полагает Александре Хассанин из Института систематики, эволюции, биоразнообразия в университете Сорбонны.
В декабре 2019 года 27 из первых 41 госпитализированных (66%) прошли через рынок, расположенный в центре города Ухань в провинции Хубэй. Но, согласно исследованию, проведенному в Уханьской больнице, самый первый выявленный случай заболевания не связан с этим рынком.
«Оценка молекулярного датирования, основанная на геномных последовательностях SARS-CoV-2, указывает на происхождение в ноябре. Это поднимает вопросы о связи между этой эпидемией COVID-19 и дикой природой», — подчеркнул Александре Хассанин.
Геном SARS-CoV-2 удалось быстро секвенировать. Это молекула РНК, состоящая примерно из 30 000 оснований, содержащая 15 генов, включая ген S, который кодирует белок, расположенный на поверхности вирусной оболочки. Для сравнения, наш геном находится в форме двойной спирали ДНК, содержащей около 3 миллиардов оснований и около 30 000 генов.
Сравнительный геномный анализ показал, что SARS-CoV-2 относится к группе бета-коронавирусов и что он очень близок к SARS-CoV, ответственному за эпидемию атипичной пневмонии, которая появилась в ноябре 2002 года в китайской провинции Гуандун и затем распространилась на 29 стран в 2003 году.
Известно, что летучие мыши рода Rhinolophus (потенциально несколько видов пещерных летучих мышей) были резервуаром этого вируса, и что небольшой плотоядный зверек, пальмовая циветта (Paguma larvata), возможно, служил в качестве промежуточного хозяина между летучими мышами и первыми случаями заболеванием людей.
С тех пор многие бета-коронавирусы были обнаружены, главным образом, у летучих мышей, но также у людей. Например, RaTG13, выделенный из летучей мыши вида Rhinolophus affinis, собранного в китайской провинции Юнань, недавно был описан как очень похожий на SARS-CoV-2: последовательности генома идентичны на 96%. Эти результаты показывают, что летучие мыши, и в частности виды рода Rhinolophus, являются резервуаром вирусов SARS-CoV и SARS-CoV-2.
7 февраля 2020 года ученые обнаружили, что в панголине был обнаружен вирус, который еще ближе к SARS-CoV-2. Учитывая 99% согласованного геномного соответствия, это указывает на более вероятный резервуар, чем летучие мыши. Однако недавнее обзорное исследование показывает, что геном коронавируса, выделенного из малазийского панголина (Manis javanica), менее похож на SARS-Cov-2, только с 90% геномной согласованности. Это указывает на то, что вирус, выделенный из ящера, вероятно, не является причиной эпидемии COVID-19.
Однако коронавирус, выделенный из панголина, сходен на 99% в конкретной области белка S, что соответствует 74 аминокислотам, участвующим в связывающем домене рецептора АСЕ (ангиотензин-превращающий фермент 2), который позволяет вирусу проникать в человеческие клетки, чтобы заразить их. Напротив, вирус RaTG13, выделенный из летучей мыши R. affinis, сильно отличается в этом конкретном регионе (только 77% сходства).
Это означает, что коронавирус, выделенный из панголина, способен проникать в клетки человека, тогда как коронавирус, выделенный из летучей мыши R. affinis, не способен.
«Эти геномные сравнения показывают, что вирус SARS-Cov-2 является результатом рекомбинации между двумя различными вирусами, один из которых близок к RaTG13, а другой ближе к вирусу панголина. Другими словами, это химера между двумя ранее существовавшими вирусами. Чтобы произошла рекомбинация, два расходящихся вируса должны были одновременно инфицировать один и тот же организм», — заявил Александре Хассанин.
«Тем не менее, пока остается неясным, в каком организме произошла эта рекомбинация: летучая мышь, панголин или другой вид? И, прежде всего, при каких условиях происходила эта рекомбинация?» — отмечает ученый.
